| Č. | Kód stanoviště | Název stanoviště (CZ) | Název stanoviště (EN) | Třída stanoviště | Prioritní | | 1 | 9410 | Acidofilní smrčiny (Vaccinio-Piceetea) | Acidophilous Picea forests of the montane to alpine levels (Vaccinio-Piceetea) | Jehličnaté lesy | Ne |
| 2 | 91U0 | Lesostepní bory | Sarmatic steppe pine forests | Jehličnaté lesy | Ne |
| 3 | 91T0 | Středoevropské lišejníkové bory | Central European lichen Scots pine forests | Jehličnaté lesy | Ne |
| 4 | 91I0 | Eurosibiřské stepní doubravy | Euro-Siberian steppic woods with Quercus spp. | Listnaté opadavé lesy | Ano |
| 5 | 91H0 | Panonské šípákové doubravy | Pannonian woods with Quercus pubescens | Listnaté opadavé lesy | Ano |
| 6 | 91G0 | Panonské dubohabřiny | Pannonic woods with Quercus petraea and Carpinus betulus | Listnaté opadavé lesy | Ano |
| 7 | 91F0 | Smíšené lužní lesy s dubem letním (Quercus robur), jilmem vazem (Ulmus laevis), j. habrolistým (U. minor), jasanem ztepilým (Fraxinus excelsior) nebo j. úzkolistým (F. angustifolia) podél velkých řek atlantské a středoevropské provincie (Ulmenion minoris) | Riparian mixed forest of Quercus robur, Ulmus laevis and Ulmus minor, Fraxinus excelsior or Fraxinus angustifolia along the great rivers (Ulmenion minoris) | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 8 | 91E0 | Smíšené jasanovo-olšové lužní lesy temperátní a boreální Evropy (Alno-Padion, Alnion incanae, Salicion albae) | Alluvial forests with Alnus glutinosa and Fraxinus excelsior (Alno-Padion, Alnion incanae, Salicion albae) | Listnaté opadavé lesy | Ano |
| 9 | 91D0 | Rašelinný les | Bog woodland | Smíšené lesy | Ano |
| 10 | 9190 | Staré acidofilní doubravy s dubem letním (Quercus robur) na písčitých pláních | Old acidophilous oak woods with Quercus robur on sandy plains | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 11 | 9180 | Lesy svazu Tilio-Acerion na svazích, sutích a v roklích | Tilio-Acerion forest of slopes, screes and ravines | Jehličnaté lesy | Ano |
| 12 | 9170 | Dubohabřiny asociace Galio-Carpinetum | Galio-Carpinetum oak-hornbeam forests | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 13 | 9150 | Středoevropské vápencové bučiny (Cephalanthero-Fagion) | Medio-European limestone beech forests of the Cephalanthero-Fagion | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 14 | 9140 | Středoevropské subalpínské bučiny s javorem (Acer) a šťovíkem horským (Rumex arifolius) | Medio-European subalpine beech woods with Acer and Rumex arifolius | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 15 | 9130 | Bučiny asociace Asperulo-Fagetum | Asperulo-Fagetum beech forests | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 16 | 9110 | Bučiny asociace Luzulo-Fagetum | Luzulo-Fagetum beech forests | Listnaté opadavé lesy | Ne |
| 17 | 8310 | Jeskyně nepřístupné veřejnosti | Caves not open to the public | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 18 | 8230 | Pionýrská vegetace silikátových skal (Sedo-Scleranthion, Sedo albi-Veronicion dillenii) | Siliceous rock with pioneer vegetation of the Sedo-Scleranthion or of the Sedo albi-Veronicion dillenii | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 19 | 8220 | Chasmofytická vegetace silikátových skalnatých svahů | Siliceous rocky slopes with chasmophytic vegetation | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 20 | 8210 | Chasmofytická vegetace vápnitých skalnatých svahů | Calcareous rocky slopes with chasmophytic vegetation | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 21 | 8160 | Vápnité sutě pahorkatin a horského stupně | Medio-European calcareous scree of hill and montane levels | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ano |
| 22 | 8150 | Středoevropské silikátové sutě | Medio-European upland siliceous screes | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 23 | 8110 | Silikátové sutě horského až niválního stupně (Androsacetalia alpinae a Galeopsietalia ladani) | Siliceous scree of the montane to snow levels (Androsacetalia alpinae and Galeopsietalia ladani) | Vnitrozemské skály, sutě, písky, plochy pokryté trvale sněhem a ledem | Ne |
| 24 | 7230 | Zásaditá slatiniště | Alkaline fens | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ne |
| 25 | 7220 | Petrifikující prameny s tvorbou pěnovců (Cratoneurion) | Petrifying springs with tufa formation (Cratoneurion) | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ano |
| 26 | 7210 | Vápnitá slatiniště s mařicí pilovitou (Cladium mariscus) a druhy svazu Caricion davallianae | Calcareous fens with Cladium mariscus and species of the Caricion davallianae | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ano |
| 27 | 7150 | Prolákliny na rašelinném podloží (Rhynchosporion) | Depressions on peat substrates of the Rhynchosporion | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ne |
| 28 | 7140 | Přechodová rašeliniště a třasoviště | Transition mires and quaking bogs | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ne |
| 29 | 7120 | Degradovaná vrchoviště (ještě schopná přirozené obnovy) | Degraded raised bogs still capable of natural regeneration | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ne |
| 30 | 7110 | Aktivní vrchoviště | Active raised bogs | Vrchoviště, rašeliniště a slatiniště | Ano |
| 31 | 6520 | Horské sečené louky | Mountain hay meadows | Vlhké a mezofilní louky | Ne |
| 32 | 6510 | Extenzivní sečené louky nížin až podhůří (Arrhenatherion, Brachypodio-Centaureion nemoralis) | Lowland hay meadows (Alopecurus pratensis, Sanguisorba officinalis) | Vlhké a mezofilní louky | Ne |
| 33 | 6440 | Nivní louky říčních údolí svazu Cnidion dubii | Alluvial meadows of river valleys of the Cnidion dubii | Vlhké a mezofilní louky | Ne |
| 34 | 6430 | Vlhkomilná vysokobylinná lemová společenstva nížin a horského až alpínského stupně | Hydrophilous tall herb fringe communities of plains and of the montane to alpine levels | Alpinské a subalpinské louky | Ne |
| 35 | 6410 | Bezkolencové louky na vápnitých, rašelinných nebo hlinito-jílovitých půdách (Molinion caeruleae) | Molinia meadows on calcareous, peaty or clavey-silt-laden soils (Molinion caeruleae) | Vlhké a mezofilní louky | Ne |
| 36 | 6260 | Panonské písčité stepi | Pannonic sand steppes | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ano |
| 37 | 6250 | Panonské sprašové stepní trávníky | Pannonic loess steppic grasslands | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ano |
| 38 | 6240 | Subpanonské stepní trávníky | Sub-continental steppic grasslands | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ano |
| 39 | 6230 | Druhově bohaté smilkové louky na silikátových podložích v horských oblastech (a v kontinentální Evropě v podhorských oblastech) | Species-rich Nardus grasslands, on siliceous substrates in mountain areas (and submountain areas, in Continental Europe) | Alpinské a subalpinské louky | Ano |
| 40 | 6210 | Polopřirozené suché trávníky a facie křovin na vápnitých podložích (Festuco-Brometalia) | Semi-natural dry grasslands and scrubland facies on calcareous substrates (Festuco Brometalia) | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ne |
| 41 | 6210 | Polopřirozené suché trávníky a facie křovin na vápnitých podložích (Festuco-Brometalia), význačná naleziště vstavačovitých - prioritní stanoviště | Semi-natural dry grasslands and scrubland facies on calcareous substrates (Festuco Brometalia) (*important orchid sites) | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ano |
| 42 | 6190 | Panonské skalní trávníky (Stipo-Festucetalia pallentis) | Rupicolous pannonic grasslands (Stipo-Festucetalia pallentis) | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ne |
| 43 | 6150 | Silikátové alpínské a boreální trávníky | Siliceous alpine and boreal grasslands | Alpinské a subalpinské louky | Ne |
| 44 | 6110 | Vápnité nebo bazické skalní trávníky (Alysso-Sedion albi) | Rupicolous calcareous or basophilic grasslands of the Alysso-Sedion albi | Přirozené a polopřirozené travinné formace | Ano |
| 45 | 5130 | Formace jalovce obecného (Juniperus communis) na vřesovištích nebo vápnitých trávnících | Juniperus communis formations on heaths or calcareous grasslands | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ne |
| 46 | 40A0 | Kontinentální opadavé křoviny | Subcontinental peri-Pannonic scrub | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ano |
| 47 | 4080 | Subarktické vrbové křoviny | Sub-Arctic Salix spp. scrub | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ne |
| 48 | 4070 | Křoviny s borovicí klečí (Pinus mugo) a pěnišníkem Rhododendron hirsutum (Mugo-Rhododendretum hirsuti) | Bushes with Pinus mugo and Rhododendron hirsutum (Mugo-Rhododendretum hirsuti) | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ano |
| 49 | 4060 | Alpínská a boreální vřesoviště | Alpine and Boreal heaths | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ne |
| 50 | 4030 | Evropská suchá vřesoviště | European dry heaths | Vřesoviště a křoviny mírného pásu, Tvrdolisté křoviny | Ne |
| 51 | 3270 | Bahnité břehy řek s vegetací svazů Chenopodion rubri p.p. a Bidention p.p. | Rivers with muddy banks with Chenopodion rubri p.p. and Bidention p.p. vegetation | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 52 | 3260 | Nížinné až horské vodní toky s vegetací svazů Ranunculion fluitantis a Callitricho-Batrachion | Water courses of plain to montane levels with the Ranunculion fluitantis and Callitricho-Batrachion vegetation | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 53 | 3240 | Alpínské řeky a jejich dřevinná vegetace s vrbou šedou (Salix elaeagnos) | Alpine rivers and their ligneous vegetation with Salix elaeagnos | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 54 | 3230 | Alpínské řeky a jejich dřevinná vegetace s židoviníkem německým (Myricaria germanica) | Alpine rivers and their ligneous vegetation with Myricaria germanica | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 55 | 3220 | Alpínské řeky a bylinná vegetace podél jejich břehů | Alpine rivers and the herbaceous vegetation along their banks | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 56 | 3160 | Přirozená dystrofní jezera a tůně | Natural dystrophic lakes and ponds | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 57 | 3150 | Přirozené eutrofní vodní nádrže s vegetací typu Magnopotamion nebo Hydrocharition | Natural euthrophic lakes with Magnopotamion or Hydrocharition-type vegetation | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 58 | 3140 | Tvrdé oligo-mezotrofní vody s bentickou vegetací parožnatek | Hard oligo-mesotrophic waters with benthic vegetation of Chara spp. | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 59 | 3130 | Oligotrofní až mezotrofní stojaté vody nížinného až subalpínského stupně kontinentální a alpínské oblasti a horských poloh a jiných oblastí, s vegetací tříd Littorelletea uniflorae nebo Isoëto-Nanojuncetea | Oligotrophic to mesotrophic standing waters with vegetation of the Littorelletea uniflorae and/or of the Isoëto-Nanojuncetea | Sladkovodní stanoviště | Ne |
| 60 | 2330 | Otevřené trávníky kontinentálních dun s paličkovcem (Corynephorus) a psinečkem (Agrostis) | Inland dunes with open Corynephorus and Agrostis grasslands | Pobřežní písečné duny a kontinentální duny | Ne |
| 61 | 1340 | Vnitrozemské slané louky | Inland salt meadows | Pobřežní a halofytní stanoviště | Ano |
